A. 核糖體如何識別RNA起始密碼子和終止密碼子
在原核生物中，mRNA5』端含有一段特殊的核苷酸序列，稱為SD序列，用於mRNA與核糖體小亞基的結合，然後攜帶其實氨基酸的tRNA與小亞基結合，最後大小亞基結合，起始復合物形成，接著是肽鏈的延伸階段
在真核生物中，先由攜帶起始氨基酸tRNA與核糖體結合，mRNA再進入核糖體，真核mRNA由於沒有SD序列，與小亞基的結合依賴於帽子結構
B. 什麼是鹼基RNA是如何配對的呢
在脫氧核糖核酸和核糖核酸中，起配對作用的部分是含氮鹼基。5種鹼基都是雜環化合物，氮原子位於環上或取代氨基上，其中一部分（取代氨基，以及嘌呤環的1位氮、嘧啶環的3位氮）直接參與鹼基配對。
鹼基共有5種：胞嘧啶（縮寫作C）、鳥嘌呤（G）、腺嘌呤（A）、胸腺嘧啶（T，DNA專有）和尿嘧啶（U，RNA專有）。顧名思義，5種鹼基中，腺嘌呤和鳥嘌呤屬於嘌呤族（縮寫作R），它們具有雙環結構。胞嘧啶、尿嘧啶、胸腺嘧啶屬於嘧啶族（Y），它們的環系是一個六元雜環。RNA中，尿嘧啶取代了胸腺嘧啶的位置。值得注意的是，胸腺嘧啶比尿嘧啶多一個5位甲基，這個甲基增大了遺傳的准確性。
鹼基通過共價鍵與核糖或脫氧核糖的1位碳原子相連而形成的化合物叫核苷。核苷再與磷酸結合就形成核苷酸，磷酸基接在五碳糖的5位碳原子上。
鹼基: 腺嘌呤 - 胸腺嘧啶 - 尿嘧啶 - 鳥嘌呤 - 胞嘧啶 - 嘌呤 - 嘧啶
核苷: 腺苷 - 尿苷 - 鳥苷 - 胞苷 - 脫氧腺苷 - 胸苷 - 脫氧鳥苷 - 脫氧胞苷
核糖核苷酸: AMP - UMP - GMP - CMP - ADP - UDP - GDP - CDP - ATP - UTP - GTP - CTP - cAMP - cGMP
脫氧核苷酸: dAMP - dTMP - dUMP - dGMP - dCMP - dADP - dTDP - dUDP - dGDP - dCDP - dATP - dTTP - dUTP - dGTP - dCTP
核酸: DNA - RNA - LNA - PNA - mRNA - ncRNA - miRNA - rRNA - shRNA - siRNA - tRNA - mtDNA - Oligonucleotide
核糖核酸（縮寫為RNA，即Ribonucleic Acid)，存在於生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。
RNA由核糖核苷酸經磷酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個核糖核苷酸分子由磷酸，核糖和鹼基構成。RNA的鹼基主要有4種，即A腺嘌呤，G鳥嘌呤，C胞嘧啶，U尿嘧啶。其中，U（尿嘧啶）取代了DNA中的T胸腺嘧啶而成為RNA的特徵鹼基。
與DNA不同，RNA一般為單鏈長分子，不形成雙螺旋結構，但是很多RNA也需要通過鹼基配對原則形成一定的二級結構乃至三級結構來行使生物學功能。RNA的鹼基配對規則基本和DNA相同，不過除了A-U、G-C配對外，G-U也可以配對。
在細胞中，根據結構功能的不同，RNA主要分三類，即tRNA（轉運RNA）, rRNA（核糖體RNA）, mRNA（信使RNA）。mRNA是合成蛋白質的模板，內容按照細胞核中的DNA所轉錄；tRNA是mRNA上鹼基序列（即遺傳密碼子）的識別者和氨基酸的轉運者；rRNA是組成核糖體的組分，是蛋白質合成的工作場所。
在病毒方面，很多病毒只以RNA作為其唯一的遺傳信息載體（有別於細胞生物普遍用雙鏈DNA作載體）。
1982年以來，研究表明，不少RNA，如I、II型內含子，RNase P，HDV，核糖體大亞基RNA等等有催化生化反應過程的活性，即具有酶的活性，這類RNA被稱為核酶（ribozyme）。
20世紀90年代以來，又發現了RNAi（RNA interference，RNA干擾）等等現象，證明RNA在基因表達調控中起到重要作用。
C. r rna和mrna的區別
RNA（核糖核酸），存在於生物細胞以及部分病毒、類病毒中的遺傳信息載體。RNA由核糖核苷酸經磷酸二酯鍵縮合而成長鏈狀分子。一個核糖核苷酸分子由磷酸，核糖和鹼基構成。RNA大體可以分為三類mRNA(信使RNA)、rRNA(核糖體RNA)、tRNA(轉運RNA)。
mRNA tRNA rRNA的區別：
1、功能不同：
rRNA是組成核糖體的主要成分。核糖體是合成蛋白質的工廠。rRNA一般與核糖體蛋白質結合在一起，形成核糖體（ribosome）。
tRNA是分子最小的RNA，又稱轉運RNA。如果說mRNA是合成蛋白質的藍圖，則核糖體是合成蛋白質的工廠。tRNA把氨基酸搬運到核糖體上，tRNA能根據mRNA的遺傳密碼，依次准確地將它攜帶的氨基酸，摻入正在合成的肽鏈中，實現肽鏈的延伸。
mRNA功能是在蛋白分子合成過程中，作為「信使」分子，將基因組DNA的遺傳信息（即鹼基排列順序）傳遞至核糖體，使核糖體能夠以其鹼基排列順序摻入互補配對的tRNA分子，進而合成正確的肽鏈，實現遺傳信息向蛋白質分子的轉化。
2、細胞中的含量不同：
在大腸桿菌中，rRNA量占細胞總RNA量的75%～85%，而tRNA佔15%，mRNA僅佔3～5%。在真核生物中，轉錄形成的前體RNA中含有大量非編碼序列，大約只有25%序列經加工成為mRNA，最後翻譯為蛋白質。
(3)r語言怎樣查看rna的密碼子擴展閱讀：
RNA的組成結構：
與DNA不同，RNA一般為單鏈長分子，不形成雙螺旋結構，但是很多RNA也需要通過鹼基配對原則形成一定的二級結構乃至三級結構來行使生物學功能。RNA的鹼基配對規則基本和DNA相同，不過除了A-U、G-C配對外，G-U也可以配對。
在病毒方面，很多病毒只以RNA作為其唯一的遺傳信息載體（有別於細胞生物普遍用雙鏈DNA作載體）。細胞中還有許多種類和功能不一的小型RNA，像是組成剪接體（spliceosome）的snRNA，負責rRNA成型的snoRNA，以及參與RNAi作用的miRNA與siRNA等，可調節基因表達。
而其他如I、II型內含子、RNase P、HDV、核糖體RNA等等都有催化生化反應過程的活性，即具有酶的活性，這類RNA被稱為核酶。
D. 怎麼用r語言分析rnaseq數據
seq函數是產生序列用的他的用法是seq(from,to,by)或者是seq（下界，by=，length=） 下面是用r運行的結果 seq(2,6,2) [1] 2 4 6 seq(10,by=2,length=5) [1] 10 12 14 16 18
E. tRNA的DHU環,TψC環與反密碼環各有什麼作用
左環是二氫尿嘧啶環(d環)，它與氨基醯-trna合成酶的結合有關。右環是假尿嘧啶環(tψc環)，它與核糖體的結合有關。在反密碼子與假尿嘧啶環之間的是可變環，它的大小決定著trna分子大小。
轉運RNA（Transfer RNA），又稱傳送核糖核酸、轉移核糖核酸，通常簡稱為tRNA，是一種由76-90個核苷酸所組成的RNA，其3'端可以在氨醯-tRNA合成酶催化之下，接附特定種類的氨基酸。
結構
1、一級結構
自1965年R．W．霍利等首次測出酵母丙氨酸tRNA的一級結構即核苷酸排列順序到1983年已有200多個tRNA（包括不同生物來源、不同器官、細胞器的同功受體tRNA以及校正tRNA）的一級結構被闡明。按照A－U、G－C以及G－U鹼基配對原則。
2、二級結構
它由3個環，即D環〔因該處二氫尿苷酸（D）含量高〕、反密碼環（該環中部為反密碼子）和TΨC環〔因絕大多數tRNA在該處含胸苷酸（T）、假尿苷酸（Ψ）、胞苷酸（C）順序〕，四個莖。
即D莖（與D環聯接的莖）、反密碼莖（與反密碼環聯接）、TΨC莖（與 TΨC環聯接）和氨基酸接受莖〔也叫CCA莖，因所有tRNA的分子末端均含胞苷酸（C）、胞苷酸（C）、腺苷酸（A）順序， CCA是連接氨基酸所不可缺少的〕，以及位於反密碼莖與TΨC莖之間的可變臂構成。
F. RNA關系，高中生物，mtrRNA上分別是密碼子還是反密碼子，tRNA後怎麼表達，蛋白質在哪合成，t與r什麼關系
先解釋r、m、t
1.rRNA是構成核糖體的主要成份，為合成蛋白質提供場所。
2.mRNA是轉錄RNA，帶有遺傳信息，其上相臨三個鹼基為一個密碼子。
3.tRNA是運輸RNA，是將合成蛋白質的原料運輸至核糖體的物質，每個tRNA上只有三個鹼基，稱反密碼子。
相互關系：mRNA在細胞核內從遺傳物中獲得遺傳信息後，從核孔穿出，來到由rRNA構成的核糖體，再由tRNA提供合成原料，來進行合成蛋白質（蛋白質在核糖體中合成），轉錄是在核內，合成是在核外，tRNA在核外。
G. 密碼子、反密碼子、trna有什麼關系
1、mRNA上3個相鄰的鹼基叫密碼子,tRNA上的與mRNA 互補配對的叫翻譯密碼子,密碼子與反密碼子鹼基互補配對；
2、mRNA是從細胞核進入細胞質,攜帶遺傳信息的；
3、tRNA 是在細胞核中根據mRNA上的信息像核糖體搬運氨基酸的；
4、蛋白質合成的場所在細胞質的核糖體中.
H. RNA是什麼， r RNA是什麼 ，
1、核糖核酸（英語：Ribonucleic acid），簡稱RNA，是一類由核糖核苷酸通過3',5'-磷酸二酯鍵聚合而成的線性大分子。
自然界中的RNA通常是單鏈的，且RNA中最基本的四種鹼基為A（腺嘌呤）、U（尿嘧啶）、G（鳥嘌呤）、C（胞嘧啶），相對的，與RNA同為核酸的DNA通常是雙鏈分子，且含有的含氮鹼基為A（腺嘌呤）、T（胸腺嘧啶）、G（鳥嘌呤）、C（胞嘧啶）四種。
2、核糖體RNA（ribosomalRNA,rRNA）是生物細胞中主要的核糖核酸之一，是一種具有催化能力的核糖酶，但其單獨存在時不能如其他核糖核酸那樣發揮作用，僅在與多種核糖體蛋白質共同構成核糖體（一種無膜細胞器）後才能執行其功能。
rRNA在翻譯過程中作為肽醯轉移酶催化多肽（包括蛋白質）中氨基酸之間肽鍵的形成。rRNA是單鏈RNA，但通過折疊形成了廣泛的雙鏈區域。
(8)r語言怎樣查看rna的密碼子擴展閱讀：
RNA的分子結構與DNA非常相似，但是，兩者有以下三個主要不同點：
1、與通常是雙鏈的DNA不同，RNA通常是單鏈的，而且長度一般比DNA短得多。不過，單鏈RNA可以通過折疊形成雙鏈接構（這樣的雙鏈接構亦被稱為「莖」），tRNA中即有這樣的結構。
2、DNA中的戊糖為脫氧核糖，而RNA中的戊糖為核糖，其區別在於，脫氧核糖的2位碳上連接的是氫原子，而核糖的2位碳上連接的是羥基）。2位碳上的羥基降低了RNA的穩定性，因為它使得RNA更易被水解。
3、在DNA中，與腺嘌呤（A）互補的含氮鹼基是胸腺嘧啶（T），而在RNA中，與腺嘌呤（A）互補的含氮鹼基是尿嘧啶（U），它比胸腺嘧啶少了一個甲基。
I. 怎麼才能查看R語言某個包某函數源碼
如果是程序包中自己帶的函數，可用以下操作：
https://cran.r-project.org/
點擊左側Packages
點擊中間Table of available packages, sorted by date of publication鏈接，進入包的列表界面
ctrl+F組合鍵在網頁中搜索你關心的R包，例如包WGCNA，點擊進入此R包主界面
點擊Downloads下面的Packagesource:
WGCNA_1.51.tar.gz解壓此包，然後找到裡面名字為R的文件夾，裡面都是R語言包中包含的R的函數的代碼
如果是在bioconctor中的包，可以在bioconctor官網中搜索此R包，進入此包界面，下載.tar.gz的這個文件,尋找方法如上.
J. mRNA, tRNA, r RNA 在遺傳信息的傳遞過程中分別起什麼作用
mRNA：攜帶遺傳信息，在蛋白質合成時充當模板的RNA。
從脫氧核糖核酸（DNA）轉錄合成的帶有遺傳信息的一類單鏈核糖核酸（RNA）。它在核糖體上作為蛋白質合成的模板，決定肽鏈的氨基酸排列順序。mRNA存在於原核生物和真核生物的細胞質及真核細胞的某些細胞器（如線粒體和葉綠體）中。tRNA（又叫轉運RNA）約含70~100個核苷酸殘基，是分子量最小的RNA，佔RNA總量的16%，現已發現有100多種。tRNA的主要生物學功能是轉運活化了的氨基酸，參與蛋白質的生物合成。核糖體RNA：即rRNA，是最多的一類RNA，也是3類RNA（tRNA,mRNA,rRNA)中相對分子質量最大的一類RNA，它與蛋白質結合而形成核糖體，其功能是作為mRNA的支架，使mRNA分子在其上展開，實現蛋白質的合成。rRNA占整個RNA的82％左右。